黑客帝国动画版于2003年上映。黑客帝国动画版也被叫做骇客帝国动画版, The Animatrix。

《骇客帝国动画版》(The Animatrix)是一系列基于Matrix这一相同主题但又各自独立的动画短篇集，共有9部。其制作汇集了来自日本、韩国、美国三国的7位顶尖动画制作人，影片在“Matrix”——电影《骇客帝国》中的虚拟世界的基础之上，对“Matrix”的诞生、人类与机器之间的战争等等细节充分展开想象，勾画出Matrix世界里一幅幅不同侧面、精彩纷呈的景象。

出演黑客帝国动画版的明星有凯瑞-安·莫斯, 基努·李维斯, 大塚明夫。