X档案第3季(1995)的海报和剧照

X档案第3季于1995年上映。X档案第3季也被叫做X档案第三季, The X Files Season 3。

沿续上一季的剧情，我们的穆德当然战胜了死神。但史卡利的姐姐–玛莉莎却被误杀。目前为止，两位主角各失去了一位至亲的亲人。而内容方面，X档案的编剧似乎有用不完的点子。这季内容包括了湖中水怪、能控制人意识的精神病患、唐人街上的纷争、二次大战时日本的人体实验等等。

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The Blessing Way 3X01 09/22/95 外星档案（中）
Scully以为Mulder死了。她被停职，还发现脖子后面有个芯片。她姐姐Mellisa被误杀了。 其实Mulder还活着，在印第安老人那里接受仪式治疗。
Paper Clip 3X02 09/29/95 外星档案（下）
Mulder回来了，他和Scully一起找到一个二战交换过来的科学家，根据他的说法又找到一个叫Strughold的废矿，那里有所有接种过天花疫苗的人的DNA档案。
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D.P.O. 3X03 10/06/95 闪电人
一个叫达伦的孩子在闪电中幸存，但也拥有了释放闪电的力量，他企图杀死他暗恋的老师的丈夫以取代他。还杀了他怀疑出卖他的朋友。
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Clyde Bruckman'sFinal Repose 3X04 10/13/95 相士杀手
一个连续杀死自称算命师的人。一个保险经纪人具有预见他人死亡的能力。他用预言救了穆德，然后按照预见的方式自杀了。
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The List 3X05 10/20/95 回魂复仇者
一个被执行死刑的犯人行刑前说他会回来，有五个人将会因为冤枉他而死去
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2shy 3X06 11/03/95 网络情人
开场一对网友第一次见了面，女非常自卑，扯断了自己的幸运草项链，男一直赞美她并体贴的为她戴上，此时KISS，女突然挣脱，嘴里有液体与男人相连，早上警察发现她的尸体。她的表面被某种液体腐蚀了，肌肉完全液化了。他是个吸人脂肪的魔鬼，所以专门找那些肥胖的女人，以约会为借口。
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The Walk 3X07 11/10/95 幽灵士兵
一个住在精神病院的军官，尝试自杀多次都在最后一刻得到救治，但他却说是“他”不让我死。
原来是住在精神病院中的一个在战争中失去双手双脚的士兵将怨恨发在了他战时的上司身上，他用灵魂出窍的方式杀死他们的妻儿，并且让他们求死不得，痛苦一生。
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Oubliette 3X08 11/17/95 解脱
艾米从家中被绑架，另一个曾被绑架的露西在同一时间突然流鼻血晕倒，嘴里说着绑架者绑架时的话语（没有人可以毁了我们）。
露西和艾米产生了一种联系，所有发生在艾米身上的，都会反应在露西身上。当艾米从溺水中救活时毫发无伤，露西承受了所有艾米经受的痛苦，死去了，这是唯一能使她解脱的方法。
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Nisei 3X09 11/24/95 扑朔迷离（上）
一张记录着医生在解剖尸体时被士兵射杀的镜头，穆德和史卡利去找他，发现他刚被人用外科手术的方式杀死，一个日本人逃离现场被穆德抓住，却发现他是个高级外交官，政府要求他们放了他。史卡利去寻找相关人员，却被两个女人告知她是被外星人挟持的其中之一。
731 3X10 12/01/95 扑朔迷离（下）
事实上一个曾经在731工作过的日本医生在战争后仍然用普通人进行细菌试验，史卡利也是在他那里被植入了颈后的芯片。政府利用穆德掩盖了进行生化试验的真相。
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Revelations 3X11 12/15/95 天启
一个男孩受伤开始出现了与耶稣手心一样的伤痕，他身边的人都认为是神迹。一个自称被派来保护他的人被杀后不腐烂而且发出花香。而此时一个专杀那些自称神的使者的杀手（被怀疑换有耶路撒冷综合症也就是自以为是摩西的人），他认为杀了先知就能迎来新纪元。史卡利相信了神迹并救了那个男孩。
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War Of The Coprophages 3X12 01/05/96 粪虫（蟑螂）大战•••••
一个小镇上蟑螂不断的袭击并杀死人们，他们是金属制的蟑螂。
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Syzygy 3X13 01/26/96 双姝奇缘
一个相信撒旦信徒的小镇，接连几个高中男生死了，一对同年同月同日生的高中女生好友因为九星连珠导致能力超群，星相一结束，两人立刻恢复了正常。
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Grotesque 3X14 02/02/96 恶魔图像
华盛顿大学一节人体写生课上，一个男学生将模特画成恶魔的样子，一下课就惊慌的逃走了，男模特随即被杀死在停车场。这个男学生的房间里都是恶魔的画图并发现了杀人工具，可是五天后又有人被杀。
那个侦探因为每天想着那个凶手的思维方式，最后自己成为了魔鬼
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Piper Maru 3X15 02/09/96 追凶记（上）
一个打捞沉飞机的队伍，下水的人发现沉船里竟然有人，当他们对视时，变化发生了，当他回到船上时所有的船员都受到了高强度的辐射，只有他没事。而船的监测证明没有任何迹象。
原来那架飞机上载有原子弹。去取回它的潜艇中一名士兵中了某种邪，舰长将它锁在房间里，还在里面的士兵将他杀了，某种东西从他鼻子里流出，旁边的士兵都受到了辐射。东西仍然在那里。某个人射伤了斯科勒。这个人杀了斯考利的姐姐。
Apocrypha 3X16 02/16/96 追凶记（下）
穆德在香港遇到了一个自称克莱特的男人，他们被追撞，穆德昏倒前，看见克发出了一道光，敌人都受到了和潜艇上的人一样的辐射。神秘人说那是一个被击落的UFO,克莱特被它附身，当它流入飞碟中，克莱特被关在了那个仓库。
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Pusher 3X17 02/23/96 步步危机
一个被称为推销者的犯人在超级市场抓住，在运送时，他看见一辆天蓝色的卡车开过来，他开始不断的对警探重复天蓝色，然后警察眼里那辆卡车消失，车祸中，犯人逃走了。他能用声音或眼神操作别人的举动，类似于暗示。例如血管会膨胀直至爆裂。他因为脑瘤致使拥有了精神力量。
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Teso Dos Bichos 3X18 03/08/96 阿玛鲁
一群印第安人在挖掘现场发现了一个尸骨，博士坚持将她移走，当地人担心会发生什么不幸的事情。那是个叫塞肯族的祭祀现场。带回尸骨的人都被杀死了，猫被操纵袭击了他们。
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Hell Money 3X19 03/29/96 冥纸
一个似乎被什么追赶的男人在热闹的唐人街上奔跑，进了一间写着凶宅的房子，被里面的人捅了一刀。太平间里警卫听见焚烧炉里一个男人正在挣扎。已经有三起20到40岁的新移民中国人被活活烧死。被烧死前在焚烧炉的顶上写下“鬼”，还有未烧尽的冥纸。一个组织人们卖器官，但大多数会抽到心而只得死去。
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Tose Chung's From Outer Space' 3X20 04/12/96 科幻故事
一对情侣在约会路上被UFO阻止，两个外星人拖他们走时，又出现一个飞船，外星人面面相觑。
事实上都是军方扮演的，外星人是外套，飞碟是飞机。
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Avatar 3X21 04/26/96 梦妖
斯凯勒晚上在酒吧遇见的女人早上死在他身边，那个女人是个高级妓女，专门为政府官员服务，发现一个队伍在陷害他，似乎是为政府工作的。他一直看见穿着最爱的红色风衣亡妻。他又重新戴上了结婚戒指。
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Luagmire 3X22 05/03/96 湖怪
一个科学家企图呼吁保护青蛙，另一个拒绝的科学家被什么东西拖入了湖中。那个湖一直流传有个叫大兰的湖怪。穆德认为是位于食物链较下层的青蛙被捕获的过多，所以食物链产生了断层所致，它要寻找替代物。
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Wetwired 3X23 05/10/96 电视杀人事件
开始于一个男人在森林里掩埋一个据他说是杀人狂的男人，他后又一再的看见他杀的那个男人出现在他面前，为此他误杀了他的爱人并袭击了警察。一个主妇自认看见他丈夫与一个金发女郎在院子里嬉戏而举枪杀了邻居。他们用改变电视信号的一些讯号，来使看的人相信自己最害怕的事情发生，例如斯考利认为穆德背叛了她，进而举枪对准了穆德。
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Talitha Cumi 3X24 05/17/96 追杀令
一个男人现在快餐店对旁人絮絮叨叨，然后举枪威胁众人，一个老人站了出来试图说服他，但他看见警察还是射了一个男孩，因此被警察击中，老人用手覆盖他的伤口，伤口消失了。
老人出现在穆德的母亲的湖边的别墅里，他试图和她回忆过去，但她却说已经忘记了所有的过去。一个瞄准镜在远处注视他们的争吵。然后她中风被送进医院，写了“PALM手掌"给穆德看。
老人随即被癌人抓住。有一个能自由改变外貌的男人带着武器想去杀老人。
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